La presente invención se refiere a un detector de microarreglos de DNA por determinación de fluorescencia en formato múltiple que realiza la lectura de la fluorescencia emitida por microarreglos de DNA. La invención comprende en asociación: un sistema de iluminación, un sistema de platina porta muestras, un sistema de detección, un sistema de captura de video, y un sistema eléctrico. Dicho detector de microarreglos de DNA realiza la detección y lectura de microarreglos capturando la imagen de cada microarreglo y transmitiéndola a un ordenador con el que es posible visualizar y/o almacenar dicha imagen en un solo paso. El detector de microarreglos de DNA de la presente invención es portátil y permite su ubicación e instalación en espacios pequeños.