CARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ



DATOS GENERALES
Nombre completo   CARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ
Máximo nivel de estudios   DOCTORADO
Antigüedad académica en la UNAM   25 años
NOMBRAMIENTOS
Vigente   INVESTIGADOR TITULAR A TC No Definitivo
Centro de Ciencias Genómicas
Desde 16-09-2024
INVESTIGADOR ASOCIADO C TC No Definitivo
Centro de Ciencias Genómicas
Desde 01-05-2016 hasta 15-09-2024
PROFESOR ASIGNATURA A TP Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 16-08-2010 hasta 31-07-2016
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 01-10-2013 hasta 15-03-2015
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 16-09-2013 hasta 15-08-2014
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 16-08-2013 hasta 15-08-2014
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 01-05-2013 hasta 30-09-2013
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Ingeniería
Desde 01-10-2012 hasta 15-08-2013
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 01-12-2011 hasta 30-04-2013
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 16-05-2011 hasta 30-11-2011
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Ingeniería
Desde 01-09-2009 hasta 15-08-2011
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 01-09-2009 hasta 15-08-2010
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 01-05-2009 hasta 31-08-2009
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 16-04-2009 hasta 30-04-2009
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 01-11-2008 hasta 15-04-2009
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Ingeniería
Desde 01-11-2008 hasta 15-02-2009
PROFESOR ASIGNATURA A TP No Definitivo
Facultad de Contaduría y Administración
Desde 01-01-2008 (fecha inicial de registros en el SIIA) hasta 30-10-2008
ESTIMULOS, PROGRAMAS, PREMIOS Y RECONOCIMIENTOS
* SNI I2022 - VIGENTE
* SNI C2018 - 2021
* PRIDE C2021 - 2024
* EQUIVALENCIA PRIDE B2016 - 2021
INFORMACIÓN DE PUBLICACIONES
Firmas  
Méndez-Cruz C.-F. Mendez-Cruz, Carlos-Francisco Méndez-Cruz, CF
ID's SCOPUS  
50262483600
Áreas de conocimiento  
Biochemistry and molecular biology Biophysics Computer science, artificial intelligence Computer science, theory & methods Genetics and heredity
Mathematical and computational biology Agricultural and biological sciences (miscellaneous) Artificial intelligence Biophysics Computer Science (miscellaneous)
Computer Vision and Pattern Recognition Ecology, evolution, behavior and systematics Genetics Information systems Microbiology
Social Sciences (miscellaneous) Software
Coautorías con entidades de la UNAM  
  • Consejo Técnico y Coordinación de la Investigación Científica
  • Centro de Ciencias Genómicas
  • Laboratorio Internacional de Investigación Sobre el Genoma Humano
  • Instituto de Ingeniería
  • Instituto de Biotecnología
  • Facultad de Ciencias
  • Facultad de Contaduría y Administración
  • Facultad de Filosofia y Letras
  • Facultad de Ingeniería
 Revistas en las que ha publicado  (13):
  1. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE REGULATORY MECHANISMS, Países Bajos (2021)
  2. CEUR Workshop Proceedings, Estados Unidos America (2012)
  3. COMPUTER SPEECH AND LANGUAGE, Reino Unido (2019)
  4. DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION, Reino Unido (2017, 2020, 2024)
  5. Frontiers In Artificial Intelligence, Suiza (2024)
  6. Genomics and Informatics, (2021)
  7. KNOWLEDGE-BASED SYSTEMS, Países Bajos (2019)
  8. Lecture Notes in Computer Science, Suiza (2011, 2013, 2022)
  9. Microbial Genomics, (2022)
  10. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, Reino Unido (2019)
  11. PATTERN RECOGNITION LETTERS, Países Bajos (2016)
  12. Procedia Social and Behavioral Sciences, Países Bajos (2013)
  13. Steam-H: Science, Technology, Engineering, Agriculture, Mathematics And Health, (2020)


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Documentos indexados (WoS y Scopus)

# Título del documento Autores Año Revista Fuente Citas WoS Citas Scopus
1Unsupervised learning and natural language processing highlight research trends in a superbug1ᵉʳ autor: Méndez-Cruz C.-F., Rodríguez-Herrera J., Varela-Vega A., Mateo-Estrada V., et al.2024Frontiers In Artificial IntelligenceWoS-id: 001195969000001
Scopus-id: 2-s2.0-85189312620
00
2Automatic extraction of transcriptional regulatory interactions of bacteria from biomedical literature using a BERT-based approachCoautor y autor de correspondencia: Méndez-Cruz, CF, Varela-Vega, A, Posada-Reyes, AB2024DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATIONWoS-id: 001303493500001
Scopus-id: 2-s2.0-85202864736
00
3RegulonDB 11.0: Comprehensive high-throughput datasets on transcriptional regulation in Escherichia coli K-12Coautor: Méndez-Cruz C.-F., Tierrafría V.H., Rioualen C., Salgado H., et al.2022Microbial GenomicsWoS-id: 000812938700011
Scopus-id: 2-s2.0-85130765382
6267
4Sentence Classification to Detect Tables for Helping Extraction of Regulatory Interactions in BacteriaCoautor: Mendez-Cruz, Carlos-Francisco, Sepulveda, Dante, Rodriguez-Herrera, Joel, Varela-Vega, Alfredo, et al.2022Lecture Notes in Computer ScienceWoS-id: 000895973300012
Scopus-id: 2-s2.0-85144267224
00
5Lisen&Curate: A platform to facilitate gathering textual evidence for curation of regulation of transcription initiation in bacteriaCoautor: Méndez-Cruz C.-F., Díaz-Rodríguez M., Lithgow-Serrano O., Guadarrama-García F., et al.2021BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE REGULATORY MECHANISMSWoS-id: 000703308500001
Scopus-id: 2-s2.0-85115326527
33
6Improving classification of low-resource COVID-19 literature by using named entity recognitionCoautor: Méndez-Cruz C.-F., Lithgow-Serrano O., Cornelius J., Kanjirangat V., et al.2021Genomics and InformaticsScopus-id: 2-s2.0-85118199840
03
7Knowledge extraction for assisted curation o f summaries of bacterial transcription factor prorerties1ᵉʳ autor: Mendez-Cruz, Carlos-Francisco, Blanchet, Antonio, Godinez, Alan, Arroyo-Fernandez, Ignacio, et al.2020DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATIONWoS-id: 000601278100001
Scopus-id: 2-s2.0-85098471761
22
8Pattern Recognition Applied to the Analysis of Genomic Data and Its Association to DiseasesCoautor y autor de correspondencia: Méndez-Cruz C.-F., Jiménez-Jacinto V., Gómez-Romero L.2020Steam-H: Science, Technology, Engineering, Agriculture, Mathematics And HealthScopus-id: 2-s2.0-85103813521
00
9Unsupervised sentence representations as word information series: Revisiting TF?IDF2ᵒ autor: Méndez-Cruz C.-F., Arroyo-Fernandez, Ignacio, Sierra, Gerardo, Torres-Moreno J.-M., et al.2019COMPUTER SPEECH AND LANGUAGEWoS-id: 000461691700008
Scopus-id: 2-s2.0-85061572569
3771
10RegulonDB v 10.5: tackling challenges to unify classic and high throughput knowledge of gene regulation in E. coli K-12Coautor: Méndez-Cruz C.-F., Santos-Zavaleta A., Salgado H., Gama-Castro S., et al.2019NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000462587400034
Scopus-id: 2-s2.0-85059797142
246254
11Language features in extractive summarization: Humans Vs. MachinesCoautor y autor de correspondencia: Méndez-Cruz C.-F., Arroyo-Fernandez, Ignacio, Curiel, Arturo2019KNOWLEDGE-BASED SYSTEMSWoS-id: 000473841200001
Scopus-id: 2-s2.0-85066276989
57
12First steps in automatic summarization of transcription factor properties for RegulonDB: classification of sentences about structural domains and regulated processes1ᵉʳ autor: Mendez-Cruz, Carlos-Francisco, Gama-Castro, Socorro, Mejia-Almonte, Citlalli, Castillo-Villalba, Marco-Polo, et al.2017DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATIONWoS-id: 000412308000001
Scopus-id: 2-s2.0-85050188913
66
13Strategies towards digital and semi-automated curation in RegulonDB (vol 2017, bax012, 2017)Coautor: Mendez-Cruz, Carlos-Francisco, Rinaldi, Fabio, Lithgow, Oscar, Gama-Castro, Socorro, et al.2017DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATIONWoS-id: 000427186500001
Scopus-id: 2-s2.0-85063712388
00
14Unsupervised morphological segmentation based on affixality measurements1ᵉʳ autor: Mendez-Cruz, Carlos-Francisco, Medina-Urrea, Alfonso, Sierra, Gerardo2016PATTERN RECOGNITION LETTERSWoS-id: 000390660900019
Scopus-id: 2-s2.0-84988515318
22
15Analysis of Stylometric Variables in Long and Short Texts2ᵒ autor: Mendez-Cruz, Carlos-Francisco, Lopez-Escobedo, Fernanda, Sierra, Gerardo, Solorzano-Soto, Julian2013Procedia Social and Behavioral SciencesWoS-id: 000335785600073
110
16Extrinsic evaluation on automatic summarization tasks: Testing affixality measurements for statistical word stemming1ᵉʳ autor: Méndez-Cruz C.-F., Torres-Moreno J.-M., Medina-Urrea A., Sierra G.2013Lecture Notes in Computer ScienceScopus-id: 2-s2.0-84875827180
04
17Testing a statistical word stemmer based on affixality measurements in INEX 2012 Tweet Contextualization Track1ᵉʳ autor: Méndez-Cruz C.-F., Soriano-Morales E.-P., Medina-Urrea A.2012CEUR Workshop ProceedingsScopus-id: 2-s2.0-84922032362
01
18The GIL summarizers: Experiments in the track QA@INEX'10Coautor: Méndez-Cruz C.-F., Soriano-Morales E.-P., Medina-Urrea A., Martínez G.S.2011Lecture Notes in Computer ScienceScopus-id: 2-s2.0-80052714190
00
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Documentos no indexados (Humanindex)

# Título del documento ISSN Revista Año Fuente
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Obras con ISBN (Indautor)

# Título del documento Autores Alcance Año ISBN Fuente
1Ámbitos MorfológicosEspinosa Ochoa, Mary Rosa, Velázquez Elizalde, Alejandro, Méndez Cruz, Carlos Francisco, et al.Libro Completo20229786073059466INDAUTOR
2Patrimonio DigitalMéndez Cruz, Carlos Francisco, Molina Salinas, Claudio, Argote Espino, Denisse Lorenia, et al.Libro Completo20219786075395975INDAUTOR
3Patrimonio DigitalMéndez Cruz, Carlos Francisco, Molina Salinas, Claudio, Argote Espino, Denisse Lorenia, et al.Libro Completo20219786075396026INDAUTOR
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Proyectos

# Nombre Participantes Convocatoria Fecha Inicio Fecha Fin
1Generación automática de resúmenes para descripción de entidades biomédicasCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ,
Presupuesto de la UNAM asignado a la Dependencia01-02-201631-12-2020
2Extracción automática de interacciones regulatorias en literatura biomédica.CARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ,
Recursos PAPIIT01-01-202031-12-2021
3Extracción automática de redes de regulación transcripcional de bacterias usando literatura biomédicaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ,
PEDRO JULIO COLLADO VIDES,
Recursos PAPIIT01-01-202331-12-2025
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Participación en Comités de Tesis

# Título del documento Tipo de Tesis Sinodales Autores Año Entidad Url
1Recuperación automática de fotografías y anécdotas en facebookTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Aguirre Moro, Laura Mariana; 2016Facultad de Contaduría y Administración,
2Tecnologías del lenguaje aplicadas a la administración de conocimientoTesis de MaestríaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Serralde Galicia, Juan Luis; 2015Facultad de Contaduría y Administración,
3Análisis de riesgo de la política byod en dispositivos AndroidTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; García Solorzano, Alejandro; 2015Facultad de Contaduría y Administración,
4Análisis de fenómenos gráficos y ortográficos mediante técnicas de minería de datos en el corpus electrónico para el estudio de la lengua escritaTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; García Álvarez, Bianca; López Hernández, Adrián; 2014Facultad de Contaduría y Administración,
5Propuesta de optimización de la arquitectura de corpus electrónicos del grupo de ingeniería lingüísticaTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Rosales Martínez, Alejandro; 2014Facultad de Contaduría y Administración,
6Informática emprendedora : el alumno en informática de la UNAM ante una vida laboral independienteTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Cejudo Esquivel, Rogelio; 2013Facultad de Contaduría y Administración, Facultad de Ingeniería,
7Optimización del generador de concordancias del corpus histórico del español en México (CHEM) comparación entre manejadores de bases de datos relacionales y administración de desempeño de bases de datosTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Vargas Mejia, Julio Cesar; 2013Facultad de Contaduría y Administración, Facultad de Ingeniería,
8Desarrollo de una aplicación para la consulta y administración de un corpus lingüístico electrónico : una aportación tecnológica al corpus histórico del español en MéxicoTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Gómez Chavarria, Manuel Alejandro; González Castañeda, Claudia; 2010Facultad de Contaduría y Administración, Facultad de Ingeniería,
9Mineria de datos dentro del proceso de KDD aplicado a la base de datos de circulación bibliográfica de la Biblioteca CentralTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Gutiérrez Hernández, Guadalupe Vanessa Carolina; Barranco Serrano, Verónica; 2008Facultad de Contaduría y Administración,
10Data warehouseTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Ibáñez Carranza, Alma Rebeca; 2008Facultad de Contaduría y Administración,
11Procesamiento de corpus linguísticos mediante el uso de bases de datos relacionalesTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Chavarría Cruz, Laura Renata; 2008Facultad de Contaduría y Administración,
12Propuesta para eficientar el servicio al cliente a traves del sistema de administración de las relaciones con clientesTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Alvarez Gonzalez, Silvia; 2007
13La minería de datos como herramienta para la toma de decisiones en el proceso de calendarización de cursos de cómputoTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Reyes García, Carlos Tomás; 2007
14Sistemas de extraccion de informacion : soluciones informaticas organizacionales basadas en datos no estructuradosTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Magaña López, Lisbeth Mireya; Luzan Hernandez, Carmen Cecilia; Martinez Reyes, José Luis; Hernandez de Anda, Juan Carlos; et al.2006
15Mapeo objeto relacional : una solucion al problema de persistencia transparenteTesis de LicenciaturaCARLOS FRANCISCO MENDEZ CRUZ; Sanchez Aguilar, Paulina; 2005
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Docencia Impartida

# Entidad Nivel Asignatura Año Semestre Alumnos
1Instituto de BiotecnologíaLicenciaturaGENOMICA INTEGRATIVA 120232024-19
2Instituto de BiotecnologíaLicenciaturaGENOMICA INTEGRATIVA 120222023-11
3Instituto de BiotecnologíaLicenciaturaGENOMICA INTEGRATIVA 220222023-12
4Instituto de BiotecnologíaLicenciaturaGENOMICA INTEGRATIVA 420222022-22
5Instituto de BiotecnologíaLicenciaturaAPLICACIONES DE LA GENOMICA 220212022-15
6Instituto de BiotecnologíaLicenciaturaGENOMICA INTEGRATIVA 120212022-14
7Instituto de BiotecnologíaLicenciaturaGENOMICA INTEGRATIVA 220212022-13
8Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaBASE DE DATOS POSRELAC. (3A.GENER.)20172017-217
9Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARROL.APLICAC.EN MANEJAD.BASES20152016-152
10Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaBASES DE DATOS20152015-267
11Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaBASES DE DATOS20142014-271
12Facultad de Contaduría y AdministraciónMaestríaEXTRACCION DE CONOCIMIENTO20142014-29
13Facultad de Filosofia y LetrasMaestríaOPTATIVALINEA DE INVESTIGACION DE METODOLOGIA20132014-16
14Facultad de Contaduría y AdministraciónMaestríaSEMINARIO DE INVESTIGACION EN CIENCIAS DE LA ADMINISTRACION20132014-121
15Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARROL.APLICAC.EN MANEJAD.BASES20132014-174
16Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaADMON.DE LA INFORMACION Y BASES DAT20132013-255
17Facultad de IngenieríaLicenciaturaPROCES.CORPUS TEXTUALES Y ORALES20132013-25
18Facultad de IngenieríaLicenciaturaPROCES.CORPUS TEXTUALES Y ORALES20122013-15
19Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaBASES DE DATOS DISTRIBUIDAS20122013-152
20Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaADMON.DE LA INFORMACION Y BASES DAT20112012-150
21Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaBASES DE DATOS POST.RELACION 3A GEN20112011-217
22Facultad de IngenieríaLicenciaturaPROCES.CORPUS TEXTUALES Y ORALES20112011-23
23Facultad de Contaduría y AdministraciónCurso de LicenciaturaDiseño y construcción en Microsoft Acces de casos de estudio de bases de datos como apoyo a la actividad docente20110
24Facultad de IngenieríaLicenciaturaPROCES.CORPUS TEXTUALES Y ORALES20102011-17
25Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARLLO APLICAC CON BASES D DATOS20102011-161
26Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARR.SIST.APIC.SIST.MANEJ.BASES D20102010-253
27Facultad de IngenieríaLicenciaturaPROCES.CORPUS TEXTUALES Y ORALES20102010-23
28Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARLLO APLICAC CON BASES D DATOS20092010-143
29Facultad de IngenieríaLicenciaturaPROCES.CORPUS TEXTUALES Y ORALES20092010-12
30Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARLLO APLICAC CON BASES D DATOS20092009-249
31Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARR.SIST.APIC.SIST.MANEJ.BASES D20092009-255
32Facultad de IngenieríaLicenciaturaPROCES.CORPUS TEXTUALES Y ORALES20082009-12
33Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaBASES DE DATOS20082009-149
34Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARR.SIST.APIC.SIST.MANEJ.BASES D20082008-262
35Facultad de Contaduría y AdministraciónLicenciaturaDESARLLO APLICAC CON BASES D DATOS20072008-159
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Capítulos de libros (Humanindex)

# Título del libro Título del capítulo ISBN Editorial Año Fuente